O Sistema de Farmacia da MMR gerencia o controle de estoque de medicamentos, histórico de retiradas por paciente, histórico de medicamentos receitados por profissional. Trabalha com lotes, realizando primeiro a saída dos medicamentos que vencerão primeiro. Gera relatórios de previsão de saída, produtos a vencer, produtos com estoque mínimo, gráficos com entradas e saídas de medicamentos, entre outros relatórios e funcionalidades de grande importância.